पूछताछ

फॉस्फोरिलीकरण, क्रोमेटिन के साथ हिस्टोन H2A के जुड़ाव को बढ़ावा देकर अरेबिडोप्सिस में मुख्य वृद्धि नियामक DELLA को सक्रिय करता है।

डेला प्रोटीन संरक्षित मास्टर हैंवृद्धि नियामकजो आंतरिक और पर्यावरणीय संकेतों के जवाब में पौधे के विकास को नियंत्रित करने में केंद्रीय भूमिका निभाते हैं। DELLA एक ट्रांसक्रिप्शनल रेगुलेटर के रूप में कार्य करता है और अपने GRAS डोमेन के माध्यम से ट्रांसक्रिप्शन फैक्टर (TFs) और हिस्टोन H2A से बंध कर प्रमोटर को लक्षित करने के लिए भर्ती किया जाता है। हाल के अध्ययनों से पता चला है कि DELLA स्थिरता दो तंत्रों के माध्यम से अनुवाद के बाद विनियमित होती है: फाइटोहोर्मोन जिबरेलिन द्वारा प्रेरित पॉलीयूबिक्विटिनेशन, जो इसके तेजी से क्षरण की ओर ले जाता है, और इसके संचय को बढ़ाने के लिए छोटे यूबिक्विटिन जैसे संशोधकों (SUMO) का संयुग्मन। इसके अलावा, DELLA गतिविधि को दो अलग-अलग ग्लाइकोसिलेशन द्वारा गतिशील रूप से विनियमित किया जाता है: DELLA-TF इंटरैक्शन को O-फ्यूकोसिलेशन द्वारा बढ़ाया जाता है लेकिन O-लिंक्ड N-एसिटाइलग्लुकोसामिन (O-GlcNAc) संशोधन द्वारा बाधित किया जाता है। हालांकि, डेला फॉस्फोराइलेशन की भूमिका अभी भी अस्पष्ट है, क्योंकि पिछले अध्ययनों ने परस्पर विरोधी परिणाम दिखाए हैं, जिनमें से कुछ ने दिखाया है कि फॉस्फोराइलेशन डेला के क्षरण को बढ़ावा देता है या कम करता है, जबकि अन्य ने दिखाया है कि फॉस्फोराइलेशन इसकी स्थिरता को प्रभावित नहीं करता है। यहाँ, हम REPRESSOR में फॉस्फोराइलेशन साइटों की पहचान करते हैंजीए1-3(आरजीए, एटीडेला) को मास स्पेक्ट्रोमेट्री विश्लेषण द्वारा अरेबिडोप्सिस थालियाना से शुद्ध किया गया और दिखाया गया कि पॉलीएस और पॉलीएस/टी क्षेत्रों में दो आरजीए पेप्टाइड्स का फॉस्फोराइलेशन एच2ए बाइंडिंग को बढ़ावा देता है और आरजीए गतिविधि को बढ़ाता है। लक्ष्य प्रमोटरों के साथ आरजीए का जुड़ाव। विशेष रूप से, फॉस्फोराइलेशन आरजीए-टीएफ इंटरैक्शन या आरजीए स्थिरता को प्रभावित नहीं करता है। हमारा अध्ययन आणविक तंत्र को प्रकट करता है जिसके द्वारा फॉस्फोराइलेशन डीईएलए गतिविधि को प्रेरित करता है।
डेला फ़ंक्शन को विनियमित करने में फॉस्फोरिलेशन की भूमिका को स्पष्ट करने के लिए, विवो में डेला फॉस्फोरिलेशन साइटों की पहचान करना और पौधों में कार्यात्मक विश्लेषण करना महत्वपूर्ण है। एमएस/एमएस विश्लेषण के बाद पौधों के अर्क की आत्मीयता शुद्धि द्वारा, हमने आरजीए में कई फॉस्फोसाइट्स की पहचान की। जीए की कमी की स्थिति में, आरएचए फॉस्फोरिलेशन बढ़ जाता है, लेकिन फॉस्फोरिलेशन इसकी स्थिरता को प्रभावित नहीं करता है। महत्वपूर्ण रूप से, सह-आईपी और चिप-क्यूपीसीआर परख से पता चला कि आरजीए के पॉलीएस/टी क्षेत्र में फॉस्फोरिलेशन एच2ए के साथ इसकी अंतःक्रिया और लक्ष्य प्रमोटरों के साथ इसके जुड़ाव को बढ़ावा देता है, जिससे उस तंत्र का पता चलता है जिसके द्वारा फॉस्फोरिलेशन आरजीए फ़ंक्शन को प्रेरित करता है।
RGA को LHR1 उपडोमेन की TF के साथ अंतःक्रिया के माध्यम से लक्ष्य क्रोमेटिन में भर्ती किया जाता है और फिर अपने PolyS/T क्षेत्र और PFYRE उपडोमेन के माध्यम से H2A से जुड़ता है, जिससे RGA को स्थिर करने के लिए H2A-RGA-TF कॉम्प्लेक्स बनता है। DELLA डोमेन और GRAS डोमेन के बीच PolyS/T क्षेत्र में Pep 2 का फॉस्फोराइलेशन एक अज्ञात किनेज द्वारा RGA-H2A बाइंडिंग को बढ़ाता है। rgam2A उत्परिवर्ती प्रोटीन RGA फॉस्फोराइलेशन को समाप्त करता है और H2A बाइंडिंग में हस्तक्षेप करने के लिए एक अलग प्रोटीन संरचना को अपनाता है। इसके परिणामस्वरूप क्षणिक TF-rgam2A अंतःक्रियाओं की अस्थिरता और लक्ष्य क्रोमेटिन से rgam2A का पृथक्करण होता है। यह आंकड़ा केवल RGA-मध्यस्थ ट्रांसक्रिप्शनल दमन को दर्शाता है। आरजीए-मध्यस्थ ट्रांसक्रिप्शनल सक्रियण के लिए एक समान पैटर्न का वर्णन किया जा सकता है, सिवाय इसके कि एच2ए-आरजीए-टीएफ कॉम्प्लेक्स लक्ष्य जीन ट्रांसक्रिप्शन को बढ़ावा देगा और आरजीएएम2ए का डीफॉस्फोराइलेशन ट्रांसक्रिप्शन को कम करेगा। हुआंग एट अल.21 से संशोधित चित्र।
सभी मात्रात्मक डेटा का एक्सेल का उपयोग करके सांख्यिकीय रूप से विश्लेषण किया गया था, और स्टूडेंट के टी टेस्ट का उपयोग करके महत्वपूर्ण अंतर निर्धारित किए गए थे। प्रारंभिक रूप से नमूना आकार निर्धारित करने के लिए किसी भी सांख्यिकीय पद्धति का उपयोग नहीं किया गया था। विश्लेषण से कोई डेटा बाहर नहीं रखा गया था; प्रयोग यादृच्छिक नहीं था; शोधकर्ता प्रयोग के दौरान डेटा के वितरण और परिणामों के मूल्यांकन के प्रति अंधे नहीं थे। नमूना आकार चित्र किंवदंती और स्रोत डेटा फ़ाइल में इंगित किया गया है।
अध्ययन डिज़ाइन के बारे में अधिक जानकारी के लिए, इस आलेख से संबद्ध प्राकृतिक पोर्टफोलियो रिपोर्ट सार देखें।
मास स्पेक्ट्रोमेट्री प्रोटिओमिक्स डेटा को डेटासेट पहचानकर्ता PXD046004 के साथ PRIDE66 भागीदार रिपोजिटरी के माध्यम से प्रोटिओमएक्सचेंज कंसोर्टियम में योगदान दिया गया है। इस अध्ययन के दौरान प्राप्त अन्य सभी डेटा पूरक सूचना, पूरक डेटा फ़ाइलों और कच्चे डेटा फ़ाइलों में प्रस्तुत किए गए हैं। इस लेख के लिए स्रोत डेटा प्रदान किया गया है।

 

पोस्ट करने का समय: नवम्बर-08-2024