पूछताछबीजी

फॉस्फोरिलीकरण, क्रोमेटिन के साथ हिस्टोन H2A के जुड़ाव को बढ़ावा देकर अरेबिडोप्सिस में मास्टर वृद्धि नियामक DELLA को सक्रिय करता है।

डेला प्रोटीन संरक्षित मास्टर हैंवृद्धि नियामकोंजो आंतरिक और पर्यावरणीय संकेतों के प्रत्युत्तर में पादप विकास को नियंत्रित करने में केंद्रीय भूमिका निभाते हैं। DELLA एक प्रतिलेखन नियामक के रूप में कार्य करता है और अपने GRAS डोमेन के माध्यम से प्रतिलेखन कारकों (TFs) और हिस्टोन H2A से बंध कर लक्ष्य प्रमोटरों में शामिल हो जाता है। हाल के अध्ययनों से पता चला है कि DELLA स्थिरता का अनुवादोत्तर नियमन दो तंत्रों द्वारा होता है: फाइटोहोर्मोन जिबरेलिन द्वारा प्रेरित पॉलीयूबिक्विटिनेशन, जो इसके तीव्र विघटन का कारण बनता है, और इसके संचयन को बढ़ाने के लिए छोटे यूबिक्विटिन-जैसे संशोधकों (SUMO) का संयोजन। इसके अतिरिक्त, DELLA गतिविधि का नियमन दो भिन्न ग्लाइकोसिलेशन द्वारा गतिशील रूप से होता है: DELLA-TF अंतःक्रिया O-फ्यूकोसिलेशन द्वारा संवर्धित होती है लेकिन O-लिंक्ड N-एसिटाइलग्लुकोसामाइन (O-GlcNAc) संशोधन द्वारा बाधित होती है। हालाँकि, डेला फॉस्फोराइलेशन की भूमिका अभी भी अस्पष्ट है, क्योंकि पिछले अध्ययनों में परस्पर विरोधी परिणाम सामने आए हैं, जिनमें से कुछ अध्ययनों में यह दर्शाया गया है कि फॉस्फोराइलेशन डेला के क्षरण को बढ़ावा देता है या कम करता है, जबकि कुछ अध्ययनों में यह दर्शाया गया है कि फॉस्फोराइलेशन इसकी स्थिरता को प्रभावित नहीं करता है। यहाँ, हम REPRESSOR में फॉस्फोराइलेशन स्थलों की पहचान करते हैं।ga1-3(RGA, AtDELLA) को मास स्पेक्ट्रोमेट्री विश्लेषण द्वारा अरेबिडोप्सिस थालियाना से शुद्ध किया गया और दिखाया गया कि PolyS और PolyS/T क्षेत्रों में दो RGA पेप्टाइड्स का फॉस्फोराइलेशन H2A बाइंडिंग को बढ़ावा देता है और RGA गतिविधि को बढ़ाता है। RGA का लक्ष्य प्रमोटरों के साथ जुड़ाव। उल्लेखनीय रूप से, फॉस्फोराइलेशन RGA-TF अंतःक्रियाओं या RGA स्थिरता को प्रभावित नहीं करता है। हमारा अध्ययन उस आणविक क्रियाविधि को प्रकट करता है जिसके द्वारा फॉस्फोराइलेशन DELLA गतिविधि को प्रेरित करता है।
डेला (DELLA) के कार्य को विनियमित करने में फॉस्फोराइलेशन की भूमिका को स्पष्ट करने के लिए, जीवित जीवों में डेला फॉस्फोराइलेशन स्थलों की पहचान करना और पौधों में कार्यात्मक विश्लेषण करना महत्वपूर्ण है। पादप अर्क के एफिनिटी शुद्धिकरण और उसके बाद MS/MS विश्लेषण द्वारा, हमने RGA में कई फॉस्फोसाइट्स की पहचान की। GA की कमी की स्थिति में, RHA फॉस्फोराइलेशन बढ़ जाता है, लेकिन फॉस्फोराइलेशन इसकी स्थिरता को प्रभावित नहीं करता है। महत्वपूर्ण रूप से, co-IP और ChIP-qPCR परीक्षणों से पता चला है कि RGA के PolyS/T क्षेत्र में फॉस्फोराइलेशन, H2A के साथ इसकी अंतःक्रिया और लक्ष्य प्रमोटरों के साथ इसके जुड़ाव को बढ़ावा देता है, जिससे उस क्रियाविधि का पता चलता है जिसके द्वारा फॉस्फोराइलेशन RGA के कार्य को प्रेरित करता है।
RGA को LHR1 उपडोमेन की TF के साथ अन्योन्यक्रिया के माध्यम से लक्ष्य क्रोमेटिन में भर्ती किया जाता है और फिर यह अपने PolyS/T क्षेत्र और PFYRE उपडोमेन के माध्यम से H2A से जुड़कर H2A-RGA-TF कॉम्प्लेक्स बनाता है जो RGA को स्थिर करता है। DELLA डोमेन और GRAS डोमेन के बीच PolyS/T क्षेत्र में एक अज्ञात काइनेज द्वारा Pep 2 का फॉस्फोराइलेशन RGA-H2A बंधन को बढ़ाता है। rgam2A उत्परिवर्ती प्रोटीन RGA फॉस्फोराइलेशन को समाप्त कर देता है और H2A बंधन में बाधा डालने के लिए एक अलग प्रोटीन संरचना अपना लेता है। इसके परिणामस्वरूप क्षणिक TF-rgam2A अन्योन्यक्रियाएँ अस्थिर हो जाती हैं और rgam2A लक्ष्य क्रोमेटिन से अलग हो जाता है। यह चित्र केवल RGA-मध्यस्थ प्रतिलेखन दमन को दर्शाता है। आरजीए-मध्यस्थ ट्रांसक्रिप्शनल सक्रियण के लिए भी एक समान पैटर्न वर्णित किया जा सकता है, सिवाय इसके कि H2A-RGA-TF कॉम्प्लेक्स लक्ष्य जीन ट्रांसक्रिप्शन को बढ़ावा देगा और rgam2A का डीफॉस्फोराइलेशन ट्रांसक्रिप्शन को कम करेगा। चित्र हुआंग एट अल.21 से संशोधित।
सभी मात्रात्मक आँकड़ों का एक्सेल का उपयोग करके सांख्यिकीय विश्लेषण किया गया और स्टूडेंट के टी-टेस्ट का उपयोग करके सार्थक अंतर निर्धारित किए गए। नमूने के आकार को प्रारंभिक रूप से निर्धारित करने के लिए किसी सांख्यिकीय पद्धति का उपयोग नहीं किया गया। विश्लेषण से कोई भी आँकड़ा बाहर नहीं रखा गया; प्रयोग यादृच्छिक नहीं था; शोधकर्ता प्रयोग के दौरान आँकड़ों के वितरण और परिणामों के मूल्यांकन से अनभिज्ञ नहीं थे। नमूने का आकार चित्र लेजेंड और स्रोत डेटा फ़ाइल में दर्शाया गया है।
अध्ययन डिज़ाइन के बारे में अधिक जानकारी के लिए, इस लेख से संबद्ध प्राकृतिक पोर्टफोलियो रिपोर्ट सार देखें।
मास स्पेक्ट्रोमेट्री प्रोटिओमिक्स डेटा PRIDE66 पार्टनर रिपॉजिटरी के माध्यम से प्रोटिओमएक्सचेंज कंसोर्टियम को डेटासेट पहचानकर्ता PXD046004 के साथ प्रदान किया गया है। इस अध्ययन के दौरान प्राप्त अन्य सभी डेटा पूरक सूचना, पूरक डेटा फ़ाइलों और रॉ डेटा फ़ाइलों में प्रस्तुत किए गए हैं। इस लेख के लिए स्रोत डेटा प्रदान किया गया है।

 

पोस्ट करने का समय: 8 नवंबर 2024