पूछताछबीजी

फॉस्फोरिलेशन, क्रोमेटिन के साथ हिस्टोन H2A के जुड़ाव को बढ़ावा देकर, अरेबिडोप्सिस में मास्टर ग्रोथ रेगुलेटर DELLA को सक्रिय करता है।

डेला प्रोटीन संरक्षित मास्टर हैंविकास नियामकडेला (DELLA) आंतरिक और पर्यावरणीय संकेतों के प्रति प्रतिक्रिया में पादप विकास को नियंत्रित करने में केंद्रीय भूमिका निभाता है। डेला (DELLA) एक प्रतिलेखन नियामक के रूप में कार्य करता है और अपने GRAS डोमेन के माध्यम से प्रतिलेखन कारकों (TFs) और हिस्टोन H2A से जुड़कर लक्ष्य प्रमोटरों तक पहुंचता है। हाल के अध्ययनों से पता चला है कि डेला (DELLA) की स्थिरता दो तंत्रों के माध्यम से अनुवादोत्तर विनियमित होती है: पादप हार्मोन जिबरेलिन द्वारा प्रेरित पॉलीयूबीक्विटिनेशन, जो इसके तीव्र अपघटन की ओर ले जाता है, और इसके संचय को बढ़ाने के लिए छोटे यूबीक्विटिन-जैसे संशोधकों (SUMO) का संयुग्मन। इसके अतिरिक्त, डेला (DELLA) की गतिविधि दो अलग-अलग ग्लाइकोसिलेशन द्वारा गतिशील रूप से विनियमित होती है: डेला (DELLA)-TF (TF) अंतःक्रिया O-फ्यूकोसिलेशन द्वारा बढ़ाई जाती है लेकिन O-लिंक्ड N-एसिटाइलग्लूकोसामाइन (O-GlcNAc) संशोधन द्वारा बाधित होती है। हालाँकि, डेला फॉस्फोरिलेशन की भूमिका अभी भी स्पष्ट नहीं है, क्योंकि पिछले अध्ययनों में विरोधाभासी परिणाम सामने आए हैं, जिनमें से कुछ अध्ययनों में फॉस्फोरिलेशन को डेला के क्षरण को बढ़ावा देने या कम करने वाला बताया गया है, जबकि अन्य अध्ययनों में इसकी स्थिरता पर कोई प्रभाव नहीं पड़ने की बात कही गई है। यहाँ, हम रिप्रेसर में फॉस्फोरिलेशन स्थलों की पहचान करते हैं।ga1-3मास स्पेक्ट्रोमेट्री विश्लेषण द्वारा अरेबिडोप्सिस थैलिआना से शुद्ध किए गए (आरजीए, एटडेला) का अध्ययन दर्शाता है कि पॉलीएस और पॉलीएस/टी क्षेत्रों में दो आरजीए पेप्टाइड्स का फॉस्फोरिलीकरण एच2ए बंधन को बढ़ावा देता है और आरजीए गतिविधि को बढ़ाता है। आरजीए का लक्ष्य प्रमोटरों के साथ जुड़ाव भी देखा गया। विशेष रूप से, फॉस्फोरिलीकरण आरजीए-टीएफ अंतःक्रियाओं या आरजीए स्थिरता को प्रभावित नहीं करता है। हमारा अध्ययन उस आणविक तंत्र को उजागर करता है जिसके द्वारा फॉस्फोरिलीकरण डेला गतिविधि को प्रेरित करता है।
DELLA के कार्य को नियंत्रित करने में फॉस्फोरिलेशन की भूमिका को स्पष्ट करने के लिए, जीवित पौधों में DELLA फॉस्फोरिलेशन स्थलों की पहचान करना और कार्यात्मक विश्लेषण करना महत्वपूर्ण है। पादप अर्क के एफिनिटी प्यूरिफिकेशन और उसके बाद MS/MS विश्लेषण द्वारा, हमने RGA में कई फॉस्फोसाइट्स की पहचान की। GA की कमी की स्थिति में, RHA फॉस्फोरिलेशन बढ़ता है, लेकिन फॉस्फोरिलेशन इसकी स्थिरता को प्रभावित नहीं करता है। महत्वपूर्ण रूप से, को-IP और ChIP-qPCR परीक्षणों से पता चला कि RGA के PolyS/T क्षेत्र में फॉस्फोरिलेशन H2A के साथ इसकी अंतःक्रिया और लक्ष्य प्रमोटरों के साथ इसके जुड़ाव को बढ़ावा देता है, जिससे वह तंत्र प्रकट होता है जिसके द्वारा फॉस्फोरिलेशन RGA के कार्य को प्रेरित करता है।
LHR1 सबडोमेन और TF की परस्पर क्रिया के माध्यम से RGA लक्षित क्रोमेटिन में भर्ती होता है और फिर अपने PolyS/T क्षेत्र और PFYRE सबडोमेन के माध्यम से H2A से जुड़कर H2A-RGA-TF कॉम्प्लेक्स बनाता है, जिससे RGA स्थिर हो जाता है। DELLA डोमेन और GRAS डोमेन के बीच PolyS/T क्षेत्र में Pep 2 का एक अज्ञात काइनेज द्वारा फॉस्फोराइलेशन RGA-H2A बंधन को बढ़ाता है। rgam2A उत्परिवर्ती प्रोटीन RGA फॉस्फोराइलेशन को समाप्त कर देता है और H2A बंधन में बाधा डालने के लिए एक अलग प्रोटीन संरचना अपना लेता है। इसके परिणामस्वरूप क्षणिक TF-rgam2A अंतःक्रियाओं का अस्थिरीकरण होता है और rgam2A लक्षित क्रोमेटिन से अलग हो जाता है। यह चित्र केवल RGA-मध्यस्थता वाले प्रतिलेखन दमन को दर्शाता है। आरजीए-मध्यस्थता वाले प्रतिलेखन सक्रियण के लिए भी इसी प्रकार का पैटर्न वर्णित किया जा सकता है, सिवाय इसके कि एच2ए-आरजीए-टीएफ कॉम्प्लेक्स लक्ष्य जीन प्रतिलेखन को बढ़ावा देगा और आरजीएएम2ए का विफॉस्फोराइलेशन प्रतिलेखन को कम कर देगा। चित्र को हुआंग एट अल.21 से संशोधित किया गया है।
सभी मात्रात्मक आंकड़ों का सांख्यिकीय विश्लेषण एक्सेल का उपयोग करके किया गया, और स्टूडेंट के टी-टेस्ट का उपयोग करके महत्वपूर्ण अंतर निर्धारित किए गए। नमूने के आकार को प्रारंभिक रूप से निर्धारित करने के लिए किसी भी सांख्यिकीय विधि का उपयोग नहीं किया गया। विश्लेषण से कोई भी डेटा बाहर नहीं रखा गया; प्रयोग यादृच्छिक नहीं था; प्रयोग और परिणामों के मूल्यांकन के दौरान शोधकर्ताओं को डेटा के वितरण की जानकारी थी। नमूने का आकार चित्र के विवरण और स्रोत डेटा फ़ाइल में दर्शाया गया है।
अध्ययन के स्वरूप के बारे में अधिक जानकारी के लिए, इस लेख से संबंधित नेचुरल पोर्टफोलियो रिपोर्ट का सारांश देखें।
मास स्पेक्ट्रोमेट्री प्रोटिओमिक्स डेटा को PRIDE66 पार्टनर रिपॉजिटरी के माध्यम से ProteomeXchange कंसोर्टियम में डेटासेट पहचानकर्ता PXD046004 के साथ योगदान दिया गया है। इस अध्ययन के दौरान प्राप्त अन्य सभी डेटा पूरक जानकारी, पूरक डेटा फ़ाइलें और कच्चा डेटा फ़ाइलें में प्रस्तुत किए गए हैं। इस लेख के लिए स्रोत डेटा प्रदान किया गया है।

 

पोस्ट करने का समय: 8 नवंबर 2024